两个学校的选择要根据自己的专业来选择目标学校的硕士学位授权点，来进行两者的比对。

上海海事大学

国家重点（培育）学科：交通运输规划与管理（隶属交通运输学院）

交通部重点学科：产业经济学，交通运输规划与管理。

上海市重点学科：载运工具运用工程、交通运输规划与管理、物流管理与工程、港口机械电子工程、国际法学（海商法）。

截止至2014年，上海海事大学共拥有5个国家级特色专业，17个上海市本科教育高地，“十一五”国家级规划教材19部，国家级精品课程1门，上海市精品课程23门。

上海海事大学拥有2个国家级实验教学示范中心，2个国家级虚拟仿真实验教学示范中心，5个国家级实践教学示范中心，1个全国示范性工程专业学位研究生联合培养基地。

江苏科技大学有1个江苏高校优势学科，2个江苏省重点序列学科，5个省重点培育一级学科。

江苏科技大学省级重点学科：

船舶与海洋工程、船舶与海洋结构物设计制造、管理科学与信息工程、船舶与海洋工程、材料科学与工程、船舶与海洋结构物设计制造、特种经济动物饲养、材料加工工程、轮机工程、管理科学与工程。